耳鼻咽喉病区于2009年9月26日整体搬迁至市一院分院并成立淮安市耳鼻咽喉医院。为方便广大患者就诊，搬迁后，市一院耳鼻咽喉门急诊正常开放，同时为病员提供在市一院和分院之间往来的免费班车服务。耳鼻咽喉科颇具技术特色，开设病床60张，配备有高精尖的专科检查和治疗设备，拥有主任医师3名、副主任医师5名、主治医师2名、硕士生3名、南京医科大学专职副教授2名。科主任李佩忠主任医师是省“333工程”学科带头人，为江苏省第九、十、十一届人大代表，曾赴英国留学深造。 　　耳鼻咽喉科积极发挥人才优势，大力提高专科技术水平，广泛开展临床科研工作和新技术、新项目。年出院病人2000人次，年手术量1500台次，在省内处于先进水平。在分泌性中耳炎、中耳分泌液的分子生物学研究、功能性鼻窦内窥镜治疗鼻窦炎及鼻息肉、鼻通气功能研究、喉Ca的各种类型手术、以及手术治疗阻塞性呼吸暂停综合征方面，始终保持了技术的先进性，并处于省内领先水平，近年来广泛开展头颈部肿瘤的手术治疗、鼓室成形术、喉显微手术及等离子射频消融治疗上呼吸道阻塞性疾病，并取得极佳的疗效，同时在体内外检测过敏原及过敏性鼻炎的治疗方面紧跟国际先进水平，取得了满意的效果。该科拥有莱卡手术显微镜、史赛克鼻窦内窥镜、耳科电钻、美国杰西低温等离子治疗系统，进口的电测听仪、声导抗仪、脑干电位仪、耳声发射仪、日本奥林巴斯电子鼻咽喉镜、耳内镜等一大批高精尖的专科检查和治疗设备。在中华级及核心期刊发表论文30余篇，获市级科技进步奖10余项