巴塘县中藏医院在省、州、县各级领导部门的关怀与支持下于1991年创建。医院院址位于巴塘县西郊文化街靠霞桑桥处。医院用地面积为2536.19平方米，其中，办公楼使用面积920平方米（办公楼为三层混砖结构）；宿舍楼使用面积616.19平方米，2010年在省州有关部门和领导的关怀下，编制上调到50张床位，75人。目前全院有工作人员20人，其中科技人员18人，行政后勤人员3人，16名科技人员中，中医专业人员6人，针灸师1人，藏医专业人员9人，其中，副主任医师4人，主治医师8人，医师4人。我院设正副院长各1人，实行院科两级管理制度。医院虽建院日浅，但经有关部门的大力支持及全院职工的艰苦努力下，通过科学管理、实行院科两级管理模式、引进“病人选择医生”及门诊两班制上班等利民便民服务措施的开展，单位取得了一些成绩和发展，年收入从92年的不到10万发展到2009年的60多万，固定资产也达到了100多万，于2000年成为我州第三个省级达标藏医院，并先后荣获省级卫生先进单位、州级精神文明先进单位、州级综治先进模范单位等荣誉称号，并年年是县卫生达标先进单位，在巴塘县群众测评中，服务质量和服务态度都是各医疗单位中口碑最好的卫生单位，取得了极大的社会效益和经济效益。同时于1998年通过贷款建立了“巴塘县中藏医院制剂室”，制剂室虽然一直发展得很艰难，但到2009年年产值也达到了20万余元，除仁青系列外，一般临床常用的藏成药全部都是本院制剂室所制，并供给我县四区十八乡卫生院，所自制和生产的藏药成品在临床上也取得了很好的疗效，深受农牧民的喜爱。并自建院以来一直肩负培养乡村藏医医生及对实习生的培养工作。为巴塘县的中藏医药事业作出了极大的贡献。