高邮市中医医院是一所集中医医疗、预防、教学、科研、急救为一体的综合性三级乙等中医医院，是江苏省首批中医“治未病”健康工程试点单位，南京中医药大学、安徽中医药大学教学医院，国家中医药管理局全国名老中医药专家王琦传承工作室共建单位。  医院现有职工635人、其中卫技人员575人、高级职称94人、中级职称172人、硕士研究生21人。拥有江苏省“333工程”培养对象1人、江苏省优秀中青年中医临床人才研修项目培养对象1人、高邮市有突出贡献的中青年专家13人、高邮市名中医10人。  医院拥有两个院区，建筑面积6万平方米，编制床位500张，设有33个临床医技科室，14个病区。针灸推拿科为国家中医药管理局农村中医特色专科建设单位、肿瘤科为江苏省中医重点专科建设单位、骨伤科为扬州市中医临床重点学科建设单位；骨伤科、肾病科、儿科、肿瘤科为扬州市中医临床重点专科；设有国医大师王琦高邮工作室。  医院拥有德国西门子医用直线加速器、荷兰飞利浦64排128层CT机、美国GE1.5T核磁共振、德国西门子双板DR、德国贝朗血透机、美国GE彩色B超、日本奥林巴斯电子胃肠镜、德国科曼腹腔镜、日本奥林巴斯全自动生化分析仪、端士罗氏化学发光仪、国产高频碎石机等一大批先进诊疗设备，以及中医体质辨识仪、中医经络检测仪等一批中医诊疗设备。  医院建有符合GMP标准的制剂室，生产13种剂型、近30种中药制剂。  医院综合实力在扬州县市区中医医院当中位于前列。近年来，医院先后获得江苏省“价格诚信单位”、扬州市“规范收费医院、扬州市卫生系统医院管理年、“白求恩杯” 竟赛活动优胜单位和先进单位等称号。