东乌旗蒙医医院建立于1979年11月，现已发展成为一所集医疗、教学、科研为一体的旗县级蒙医专科医院。东乌旗蒙医医院承担着全旗5个镇，2个牧业苏木，57个嘎查人民群众的蒙医药医疗与护理、预防与保健工作，辐射全境47328平方公里，7.4万人口及周边邻近市、旗。东乌旗蒙医医院于2008年9月年迁入新址，位于乌珠穆沁广场西侧，总占地面积1.23万平方米，总建筑面积为4231平方米，其中门诊楼建筑面积为2210平方米，病房楼建筑面积为1302平方米，制剂室建筑面积为504平方米，其它用房214平方米。医院内部共设8个科室，年门诊接诊患者3万余人次；病房开放病床60张，每年接受住院患者400余人次，对所有住院患者进行蒙西医结合治疗，实施蒙医辩证施治及护理。东乌旗蒙医医院制剂室始建于1979年， 2005年通过自治区药检局验收并取得了生产资格。东乌旗蒙医学会挂靠于东乌旗蒙医医院，成立于1985年。不定期举办蒙医学会议，学术成立到至今已举办21期学术会议，在科研工作上取得了一定的成绩。1990年至1995年历时五年完成了“乌珠穆沁蒙药材资源调查及应用研究”科研课题。该项目荣获内蒙古自治区医药卫生科学技术进步三等奖。1996年出版发行的《乌珠穆沁蒙药材鉴》一书，在北方十省市（区）优秀科技图书评选中荣获一等奖、荣获全国优秀科技图书二等奖。在建设和发展物质文明的同时注重精神文明的建设工作，先后被旗党委、旗政府授予精神文明单位、社会治安综合治理先进单位、全旗科普先进单位荣誉称号、被旗委、旗政府授予全旗学习使用蒙古语言文字先进集体；被锡盟总工会授予“先进职工之家”荣誉称号、被盟委、盟行政公署授予“锡林郭勒盟抗击非典先进集体”、被锡盟城镇妇女“巾帼建功”活动领导小组授予“巾帼文明示范岗”荣誉称号、被锡盟卫生局授予“锡林郭勒盟卫生系统先进集体”、被锡盟精神文明建设委员会授予盟级精神文明单位荣誉称号；被自治区消费者协会授予“3.15”诚信单位。