北京核工业医院现有北京西城、北京房山及天津三个院区，是一所集医疗、预防保健、职业病防护、核素治疗和核应急为一体的综合性医院。   　　西城院区位于北京西城区三里河，一级甲等医院，以职业病体检、健康保健、康复医疗为特色，具有北京市卫生局批准的首批健康体检从业资质。院区开放床位45张，现有职工100多人，设有内科、外科、全科病房、妇科、中医科、口腔科、耳鼻喉科、眼科、康复科、放射科、彩超室、钼靶室、检验科、电子胃镜室、心电图室、健康管理部、体检中心等科室。   　　房山院区（原中国核工业北京四○一医院）是一家二级综合性医疗机构，承担着原子能院核辐射事故医学应急后援任务。院区开设病床280张，现有职工410人，开设临床、医技等20多个科室，其中核素治疗中心、口腔科、眼科三个专业是房山区卫生系统专业委员会主任委员单位，核素治疗中心是中华医学会核素治疗示范单位、首都医科大学核医学专业教学基地。   　　天津院区（核工业理化工程研究院原职工医院）位于天津市河东区，现有职工10余人，主要承担核理化院职工健康体检、医疗应急保障和防疫等职能，并对核理化院职工家属及周边居民提供基本门诊医疗服务。