昆山市妇幼保健所始建于1956年，是昆山市唯一一家集妇幼卫生行业管理、妇幼保健技术服务于一体的专业性公共卫生机构，1998年异地新建，总建筑面积1500平方米。昆山市妇幼保健所于2002年顺利通过了ISO9001质量体系认证，为单位的全面发展打下了坚实基础，属省内首创。2004年底又通过江苏省卫生厅等级妇幼保健所机构验收，成为苏州地区第一家获得甲等妇幼保健所称号的保健机构。 昆山市妇幼保健所与上海复旦大学附属儿科医院、复旦大学附属妇产科医院等知名医院建立了良好的长期合作关系，2012年底，成为苏州大学研究生工作站。承担着昆山市妇幼保健技术指导、妇幼卫生人员培训、妇幼保健知识宣等职能，同时面向广大妇女儿童提供系统、优质的医疗保健服务。 单位设有9个一级科室、14个二级专科，年专科门诊量达到15.6万人次，已建成市级重点学科3个、所级重点学科4个，市级学科带头人3名，引进和培养硕士研究生共8名，本科及以上学历占86.4%。单位现拥有GE-E8、GE-LOGIQe彩超、澳斯邦全自动酶标仪、雅培化学发光仪等先进设备20多台（套）。 十二五期间，昆山市妇幼保健所将紧紧抓住昆山城市建设向大城市规模化高速发展的契机，不断加大资金投入，大力引进妇幼保健专业技术人才，在妇幼保健重点学科领域大显身手，使我所的技术水平、服务能力得到大幅度提高，力争建设成为省内一流、国内知名的妇幼保健专业机构。