阜南县中医院于1998年3月组建成立，是一所集急救、医疗、康复、保健、科研、教学为一体的二级甲等中医医院。2006年被批准为“二级甲等”中医医院；2013年7月、2019年6月再次通过“二级甲等”中医医院评审验收；2011年7月，实现了创建“全国农村中医药工作先进单位”目标任务， 2017年7月再次通过“全国农村中医药工作先进单位”复审；2019年8月被省卫健委批准设置三级中医医院。现已成为市级诚信单位、城乡居民基本医疗保险定点医院、法院法医技术鉴定、各类体检和阜南县第二县域医共体龙头单位。   现有职工630人，各类专业技术人员572人，其中高级职称47人，中级职称147人；安徽省基层名中医1人，颍淮名医1人，颍淮名中医1人，颍淮基层名中医5人，阜阳市领创人才1人，安徽省基层名中医学术经验继承人2人，阜阳市县级卫生学术和学科带头人4人，阜阳市高层次专业技术后备人才1人，阜南县专业技术拔尖人才2人。   现设有急诊科、内一科（心血管病一区）、内二科（心血管病二区）、内三科（脑病一区）、内四科（脑病二区、脾胃病区、呼吸科病区）、内五科（糖尿病区、肾病区）、内六科（名医堂）、治未病科、儿科、骨伤科、外科、康复科、妇产科、眼耳鼻喉科、药剂科、检验科、放射科、超声科、心电图室等临床医技科室34个，行政职能科室20个，其中脑病科系国家级重点专科，骨伤科系省级重点专科，康复科系省级特色专科，心血管病科系市级重点专科。拥有西门子1.5T核磁共振、西门子64排螺旋CT、减影血管造影（DSA）、彩超、电子胃镜、自动生化分析仪等大中型设备100多台件。   按照三级医院标准规划建设新院，县委、县政府先后划拨183亩建设用地。其中一期工程于2018年初投入使用，占地面积50亩，建筑面积4.5万平方米，设置床位600张，年门诊患者达20万余人次，为近3万患者提供住院诊疗服务；二期工程建设项目已申报规划，预计2020年10月开工建设。   为了进一步加强医院内涵建设,坚持以中医药为主的办院方向，保持和发挥中医药特色优势，提高临床疗效和学术水平，使医院得到了快速的发展，综合实力持续强劲提升，阜南县中医院紧紧围绕新形势下中医药工作方针，以构建现代化中医院为目标，以“坚持中西并重，突出中医特色”为导向，拼搏创新，务实重干，推动县中医药事业发展，牢牢抓住“大病县内治、小病就近看，未病共同防”的工作思路，以分级诊疗、双向转诊等工作为切入点，充分发挥县中医院的城乡纽带作用，着力打造脑病科、骨伤科、康复科、心血管病科等具有中医特色的专科建设，不断满足人民群众多样化的中医药健康服务需求，切实增强人民群众对中医药健康服务的获得感，进一步改善医疗服务环境，强化医院内涵建设，提升中医药服务能力，积极推进胸痛中心、卒中中心建设，不断完善和提高自身诊疗服务能力，以三级中医院为标准，加快县中医院二期工程建设步伐，为创建三级中医医院积蓄力量、筑牢基础，真正使人民群众在家门口就能看得起病、看得上病、看得好病，逐步夯实县委、县政府提出的“百姓得实惠、医生有激情、医院得发展”的医改目标。