1988年原兴平县妇幼保健所改为兴平县妇幼保健院。由联合国人口基金会提供10万美元无偿援助。由省、地、县三级投资120万元修建的妇幼保健大楼，于1989年正式落成。妇幼保健院迁入新址。占地面积7082平方米，建筑面积2277平方米。职工64人，医疗技术人员60人。行政职能科室有办公室、财务科、总务科。门诊设有妇产科、儿科、放射科、B超室、心电图室、药房、注射室等科室。1993年，兴平撤县设市，院更名为兴平市妇幼保健院。1996年通过专家评估，市妇幼保健院成为兴平第一批挂牌的“国家爱婴医院”。1997年7月，院投资续建门诊楼1100平方米。1998年通过省卫生厅“二甲”评审，成为咸阳地区首家二级甲等妇幼保健院。1999年市妇幼保健院又建成一座640平方米的保健大楼。2008年9月16日，兴平市人民政府与中国初级保健基金会签约的农村妇女病普查项目正式启动，由市妇幼保健院具体实施，为全市31359名妇女进行了免费妇女病普查，共查出患病妇女24874人次，现场开具治疗方案22573人次。2009年5月又启动了“兴平市农村孕产妇免费住院分娩项目”市妇幼保健院等7家医院被列为定点医疗单位。同时还启动了“免费增补叶酸，预防神经经管缺陷项目”。经过二十多年的不断发展，兴平市妇幼保健院已成为兴平地区妇幼保健工作指导中心，同时也是一所具有现代化设备的妇幼保健临床医疗机构，同时也是兴平市职工医保、孕免、工伤、失业、城镇居民、失业保险医疗定点单位。院土地面积7082平方米，医疗用房建筑面积4017平方米。全院职工209人，其中聘用人员 80人。高级技术职称5人，中级职称40人。院设病床100张。共有临床、医技、行政科室31个。门诊设有妇科、产科、儿科、新生儿科、内科、外科、耳鼻喉科、口腔科、眼科、碎石科、理疗科、药剂科、检验科、波姆室、彩超室、心电图室、放射科等。主要医疗设备有彩超、B超，重症心电监护仪、婴儿高压氧舱，新生儿暖箱、胎心监护仪、新生儿抢救台、高颈电刀、高颈呼吸机、电子阴道镜、体处碎石机、全自动生化分析仪、血球计数仪、电解质、营养分析仪、电教设备等40多台（件）。妇幼保健院遵循“以人为本、诚信服务、科技兴院、儿童优先、母亲安全”的办院宗旨。先后被评为“陕西省创佳选优评差先进单位、兴平市三八红旗集体、市级文明省口示范单位、陕西省新生儿筛查先进单位、市爱国主义教育先进灾后集体”，多次被评为“卫生系统目标考核先进集体”