鄂旗蒙医院建于一九七七年，是一所集蒙医科研、教学、蒙医医疗、康复保健于一体的专科医院，国家二级乙等医院，自治区示范蒙医院，鄂尔多斯市蒙医胃肠病治疗研究中心。医院现有职工82人，编制人员61名，其中主任医师4名，副主任医师11人，主治医师(主管护师、主管药师)29名，师级30名。2010年我院门诊人次44210人次，住院人次886人次，总收入523万元，其中蒙医药收入376万元，占总收入的72%，设有蒙医科、内科、外科、妇科、骨科、五疗科、肛肠科、皮肤科、口腔科、急诊科、肝胆科、胃肠科、专家门诊等临床科室及化验、心电、彩超X光等医技科室。设有60张病床，近年来"坚持一切为人民健康"为宗旨，不断提高技术水平、扩大服务范围、突出蒙医特色、走蒙西医结合的路，聘请专家、购进日本彩色B超机，X光机，胃肠镜、碎石机、多功能心电监护仪，全自动生化仪、尿十项分析仪、多功能牙科治疗仪、多功能牵引床、微波治疗仪、骨质增生治疗仪、心电图机、氧疗仪及配套的手术设备器械、制剂设备等。与宁夏附院、内蒙附院、鄂尔多斯市蒙研所建立协作关系送病人、请专家等业务，采用蒙医药治疗肝胆病、风湿病、胃肠病、皮肤病、肾病及疑难病症均有显著疗效，开展各种手术，加强专病专科建设开展正骨、震脑、推拿、按摩、针灸、放血、药浴、拨火罐等特色疗法。应用酸马奶治疗肺病、胃病、高血压、高血脂等疾病深得广大患者的好评。