首都儿科研究所附属儿童医院是三级甲等医院、爱婴医院、规范化服务达标医院、人民满意医院、北京市危重新生儿转会诊医院、国家卫健委中国出生缺陷干预救助基金会先天性结构畸形定点医疗机构、出生缺陷救助示范基地。编制床位400张。设有24个临床科室，7个医技科室。目前，年门诊量210余万人次，年出院病人近3万人次，住院手术病人1万余人次。