广州医科大学附属第二医院是集医疗、教学与科研于一体的大型三级甲等综合性医院和高等医学院校附属医院。广州医科大学附属第二医院番禺院区位于番禺区石楼镇亚运城，院区占地面积82亩，建筑面积6.6万平方米，开放床位500张。 门诊部，亚运会结束之后，作为广州亚运会配套建设和广州新城公共卫生设施建设的项目之一，由广州医学院接管并正式筹建广州医学院第四附属医院。    2011年12月12日，广州医学院第四附属医院正式成立。    2013年4月，广州医学院获教育部批准更名为“广州医科大学”，医院随即更名为“广州医科大学附属第四医院”。    2016年12月，经广州市编委及广州医科大学批准，将广州医科大学附属第二医院、广州医科大学附属第四医院整合为广州医科大学附属第二医院，整合后原广州医科大学附属第四医院更名为“广州医科大学附属第二医院番禺院区”。