医院前身为合肥基督医院，始建于1898年，现已发展成为一所设备先进、专科齐全、技术力量雄厚，集医疗、教学、科研、预防、保健、康复、急救为一体的省级大型三级甲等综合性医院。目前由中国科学技术大学与安徽省卫生健康委员会双重管理。 医院由总院(院本部)、南区（安徽省脑科医院、安徽心血管病医院）、西区（安徽省肿瘤医院）、感染病院（合肥市传染病医院）组成，正在建设老年医学康复中心和北城医院。总编制床位2200张，开放床位5450张，设有61个临床医技科室。 医院现有在职职工7055人。有特聘院士8人，国家级人才称号11人次，国务院及省政府津贴专家113人次，省级人才称号5人，“江淮名医”50人次。 医院现有国家疑难病症诊治能力提升工程项目2项，国家临床重点专科建设项目6个，省“十二五”临床重点专科17个及培育专科9个；省“115”产业创新团队5支。移植技术、微创技术、介入技术、危急重症救治技术、细胞移植和治疗技术等关键技术在多个学科篷勃开展。是国家“示范高级卒中中心”和“中国胸痛中心”。 医院是中国科学技术大学临床医学院；是天津医科大学博士生联合培养点、山东大学安徽省医学研究生培养基地、安徽医科大学附属医院、皖南医学院教学医院。有硕士和博士生带教点53个，博士生和硕士生导师245人。入选首批国家临床教学培训示范中心，拥有国家住院医师规范化培训基地科室34个。 医院坚持科教兴院。着力实施“科研攀登计划”，以医药卫生领域前沿技术和重大疾病为主题，加大临床前研究和临床应用研究，着力打造临床研究中心，建立生物样本库、转化医学平台和临床科研大数据平台。现具备国家干细胞临床研究机构资质和风湿、内分泌、呼吸、中医肿瘤等15个专业国家药物临床试验资格，有省级研究所3个、省级医疗质量控制中心20个、省级重点实验室3个，和中国科学技术大学共建“肿瘤免疫治疗研究中心”和“脑衰老与脑疾病联合研究中心”。 经过全院职工辛勤努力，2018年入选复旦大学全国百强医院排行榜，先后获“全国文明单位” “全国卫生系统先进集体”“全国百姓放心示范医院”等80余项集体荣誉，100多人次获“中国医师奖”等国家级、省级荣誉称号。 2017年8月正式揭牌全国首家智慧医院—“安徽省立智慧医院（人工智能辅助诊疗中心）”，2017年12月成为中国科学技术大学附属第一医院，揭开了医院发展的新纪元。