昆山市疾病预防控制中心是政府举办的集疾病预防与控制、检验检测与评价、应用研究与指导、技术管理与服务为一体的疾病防控中心。昆山市疾病预防控制中心的前身是昆山县血吸虫病防治站、昆山市卫生防疫站，50年多来为昆山消灭血吸虫病、消除碘缺乏病、昆山市创建国家卫生城市作出了显著成绩，并在计划免疫、学校卫生、劳动卫生、食品卫生、饮用水卫生、急慢性传染病防治等工作中作出了显著成绩。儿童计划免疫通过全国计划免疫接种县级第三个85%达标审评，血吸虫病防治获国家卫生部、农业部、水利部颁发的“消灭血吸虫病达标县”奖牌。1999年获全国县级一等卫生防疫站，1999年起成为苏州大学医学院实习基地。 随着国家卫生监督和疾病控制两项体制改革的不断深化，经昆山市人民政府批准，于2001年12月11日正式成立昆山市疾病预防控制中心(昆山市卫生检测中心)。中心自成立以来，承担着全市200万人口疾病的控制和管理工作，在重大疾病防治、传染病防治、计划免疫、慢性非传染性疾病防治和职业卫生、食品环境卫生、学校卫生监测、卫生检测检验、创建国家卫生城市等工作方面取得了显著成效，为昆山经济建设和人民身体健康做出了应有的贡献。2002年度获江苏省寄生虫病防治先进集体称号；2003年被授予江苏省防治非典型肺炎先进单位，昆山市防治非典型肺炎工作先进集体等荣誉称号；2004年顺利通过了实验室国家认可工作，标志着中心出具的检测报告在世界上50多个国家被认可；2005年获昆山市文明单位称号；2006年被评为苏州市“十五”期间血寄地防工作先进集体。2006年有1项课题获省卫生厅科技立项，2007-2008年有2项课题获苏州市科技进步奖和昆山市科学进步奖。2009年获全国高血压社区规范化管理项目先进单位；昆山市2008-2009年度文明单位；2007-2009年苏州卫生行业文明单位；2006-2008年苏州市创建文明单位工作先进单位；2009-2011年苏州市文明单位。 昆山市疾病预防控制中心全体干部员工将继承和弘扬血防精神，致力打造新世纪疾病预防控制体系，为全领域、多方位保障经济社会进步、保障人民群众健康继续发挥重要作用。