忠县疾病预防控制中心前身为原忠县卫生防疫站， 2002年6月11日，忠县机构编制委员会忠编发〔2002〕28号文件同意撤销忠县卫生防疫站，组建忠县疾病预防控制中心和忠县卫生局卫生监督所。2002年6月29日，忠县疾病预防控制中心正式挂牌成立，承担全县疾病预防与控制、突发公共卫生事件应急处置、健康危害因素监测与干预、实验室检测检验与评价、健康教育与健康促进、技术管理与应用研究指导等任务，是全县疾病预防控制技术指导中心。占地面积2000m2，建筑面积6500 m2，业务用房面积3500 m2。截止2010年底，共有职工58人，其中本科10人，大专29人，中专16人，高中及以下3人；副高职称5人，中级职称16人，助理职称21人，员级职称10。内设办公室、财务后勤科、公共卫生科、防疫科、地方病慢性病防治科、检验科（技术管理科）、预防医学门诊部（结防科）等7个内设机构。拥有荧光定量PCR扩增仪、气相色谱仪、原子吸收分光光度计、紫外分光光度计、酶标仪、生化分析仪、荧光显微镜、倒置显微镜、超净工作台、500mA X光机等设备100余台件。