鄂市疾控中心成立于1957年，2003年改组更名为鄂尔多斯市疾控中心。中心建筑面积8000㎡，实验室的建筑面积有4800㎡。设有门诊部、职业卫生科、放射防护科、结核科、食品与环境卫生科、计划免疫科等23个职能和专业科室。中心现在岗在编人员138人，专业技术人员134名。占职工总数97％。其中卫生技术人员129名，占职工总数94.69%；占职称总数94%；高级职称77名，占职工总数55.79%；其中正高33名，占职称总数23.9%；副高44名，占职称总数31.8%；中级38名，占职称总数27.5%；初级23名，占职称总数16.6%。