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  • 出生缺陷异常基因 NGS 检测

丁香医生审稿专业委员会同行评议通过
    出生缺陷异常基因 NGS 检测
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    丁香医生医学团队

    丁香医生医学团队

    审核专家
    丁香医生医学团队

    丁香医生医学团队

    · 主要检查单基因遗传相关疾病,如先天性耳聋。
    · 一般取脐带血检测。
    · 结果较复杂,需专业人士解读。
    简介
    适应证
    禁忌证
    注意事项
    并发症
    结果解读
    更多信息
    更多
  • 简介

    出生缺陷异常基因(NGS)检测是什么?

    NGS(Next Generation Sequencing,二代基因测序) 出生缺陷异常基因检测,通俗来说,就是对新生儿进行基因检测。

    • 通常是在新生儿出生时,采脐带血或出生后 2~7 天采足底血进行二代基因测序。

    • 主要是检测新生儿基因是否异常,可以筛查基因异常相关疾病,如先天性耳聋、地中海贫血等 [1]。

    • 此检查为实验室检查。2017 年,全球基因组学与健康联盟监管与伦理工作组儿科团队建议,可将基因检测应用于新生儿疾病筛查 [2,3]。

    出生缺陷异常基因(NGS)检测有哪些项目?

    主要包括基因组变异(碱基置换、重复、缺失、插入、嵌合等),也能检测出染色体数目(染色体三体、染色体单体、三倍体等)、性染色体组成等变异。

    目前可检出的遗传性单基因病包括:常见的遗传代谢病(苯丙酮尿症、葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺乏症、先天性肾上腺皮质增生症等)、遗传性耳聋、地中海贫血、杜氏肌营养不良症 、脊髓性肌肉萎缩症等一百多种疾病 [4-7]。根据筛查基因数目的不同,能检测出的疾病范围也略有不同。

    出生缺陷异常基因(NGS)检测过程是怎么样的?

    新生儿科医生会向孕妇介绍目前本地区的新生儿出生缺陷筛查政策,对于有高危因素的孕妇(高龄、糖尿病、家族史等)或者要求基因测序的家庭,医生有义务告知目前采取的方法和合作平台,以及检查覆盖的疾病范围。

    孕妇及家属在产前签署知情同书后无须特殊操作,医生会在胎儿出生后采集脐带血送检。患者只需等待结果报告即可。

  • 适应证

    出生缺陷异常基因(NGS)检测什么情况下要做?

    以下情况推荐进行此项检查:

    • 传统的筛查检出异常的新生儿;
    • 父母有遗传病家族史,孕妇具有高危因素(高龄、糖尿病等);
    • 某些遗传病高发的地区。

    此外,有意向进行新生儿基因检测的家庭也可做该检查。

  • 禁忌证

    出生缺陷异常基因(NGS)检测什么情况下不能做?

    所有的新生儿都可以做,无绝对禁忌证。

  • 注意事项

    出生缺陷异常基因(NGS)检测有什么注意事项?

    无特殊注意事项。

    做检查前,孕妇及家属应与儿科医生及遗传科医生充分沟通,明确是否有必要进行检查。此外,还需要了解,基因检测并不一定能排除所有遗传疾病。

  • 并发症

    出生缺陷异常基因(NGS)检测有什么并发症?

    无特殊并发症。此检查为实验室检查,标本一般为胎儿出生时的脐带血,对婴儿及母体无损伤。

  • 结果解读

    出生缺陷异常基因(NGS)检测报告怎么看?重点关注哪部分?

    基因检测报告的专业性很强,需要专业的人士来解读,如遗传科医生。

    受检者及家属拿到检测报告后,应该到开具该检查的医生处解读检测结果,避免造成对报告的误解以及不必要的心理负担。

    报告一般有很多页,包括正文和附录两大部分。

    • 正文:包含检测机构信息、受检者信息、检测方法、检测结果、结果解释及遗传咨询等内容;受测者家属主要需要关注结果及建议部分。

    • 附录:检测结果的补充信息,如研究文献等,供临床医师和遗传咨询专家参考。

    检测结果及解释:

    • 「 未检出已知致病性基因突变及染色体异常」:说明目前的所有科学研究,都没有发现这份报告中的基因有异常。

    • 「检出突变结果」:会标明基因名称、项目、基因型、遗传方式、相关表型(代表的疾病名称和临床表现)。

    • 「突变位点评级」可分为致病性、可能致病性、临床意义不明、可能良性和良性 5 个等级 [8]。

      • 致病性和可能致病性:指示疾病发生可能性大,对临床诊断有意义,需要及早预防或处理。
      • 临床意义不明:不能直接作为临床诊断的依据,需要结合临床。必要时需对其他家庭成员进行基因检测,对患儿进行更加全面的辅助检查、跟踪调查等,来确定这种突变是否导致疾病的发生。
      • 可能良性和良性:报告中可能会列出一些基因突变,但可能为人群多态性位点或良性变异,即基于现有的医学研究,认为该突变不致病。
    • 专业的缩写及字符。当检出染色体异常时,chr 代表染色体,chr13 代表 13 号染色体,一般表明这条染色体存在异常,具体可见结果解释部分,会详细地说明几号染色体上的拷贝数变异(增加、缺失、重复等等)或者染色体三体、单体等 [9]。

    • 建议:

      • 无异常时无需特殊处理

      • 有异常时,建议监护人咨询专业遗传学或新生儿科医生,听取专业人员的建议,比如存在可能导致先天性耳聋的基因突变时,避免致耳聋风险较高的药物,提前针对耳聋进行训练或治疗 [9]。

    出生缺陷异常基因(NGS)检测结果异常需要注意些什么?有治疗措施吗?

    • 不同的基因改变,可造成不同疾病发生的风险增高。需要根据疾病的特征来干预,防止或缓解疾病造成的不良结果,如氨基糖苷类药物诱导性耳聋,若在婴儿生长的过程禁用氨基糖苷类药物,可能不会发生耳聋;如苯丙酮尿症,需给予低苯丙氨酸饮食,同时检测血苯丙氨酸浓度 [10]。

    • 及时前往生殖遗传专家门诊就诊,夫妻双方可能需要抽血,行基因、染色体检查。

    • 至遗传专家处进行专业遗传咨询解读,指导下一次妊娠 [11]。比如出现染色体拷贝数异常时,下一次妊娠需进行产前诊断或使用辅助生殖技术选择染色体无异常的胚胎。

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  • 更多信息

    出生缺陷异常基因(NGS)检测大概要多少钱?能使用医保吗?

    通常 2000~3000 元,不同地区或医院的费用不同。

    根据检测方法及检测的相关基因数目,费用也存在较大差异。

    部分地区的部分基因筛查已经纳入医保,可以咨询当地医保部门,如 2012 年开始,北京市成为全球第一个实现新生儿耳聋基因免费筛查的城市。

    出生缺陷异常基因(NGS)检测大概多久出结果?

    一般 2~3 周可拿到结果。

    参考资料
    监制:李智、梁烨华
    [1] 韩连书.新生儿遗传病基因筛查技术及相关疾病[J].浙江大学学报(医学版),2021,50(04):429-435.
    [2] Friedman JM, Cornel MC, Goldenberg AJ, et al. Genomic newborn screening: public health policy considerations and recommendations. BMC Med Genomics. 2017 Feb 21;10(1):9.
    [3] 《中国出生缺陷防治报告2012年》,中国人民共和国卫生部,2012年9月,http://www.gov.cn/gzdt/att/att/site1/20120912/1c6f6506c7f811bacf9301.pdf
    [4] 《遗传性耳聋基因变异筛查技术专家共识》专家组, 国家卫生健康委员会临床检验中心产前筛查与诊断实验室室间质评专家委员会, 国家卫生健康委员会临床检验中心新生儿遗传代谢病筛查实验室室间质评专家委员会. 遗传性耳聋基因变异筛查技术专家共识. 中华医学遗传学杂志, 2019, 36(3):195-198.
    [5] 谭梅, 卢森, 吴柳松,等. 高通量测序技术在新生儿地中海贫血基因筛查中的应用. 中国实验血液学杂志, 2015(05):1404-1409.
    [6] Yiming, Lin, Chien-Hsing, et al. Newborn Screening for Spinal Muscular Atrophy in China Using DNA Mass Spectrometry. Frontiers in genetics, 2019, 10:1255-1255.
    [7] 遗传性耳聋基因筛查规范[J].中华医学杂志,2021,101(02):97-102.
    [8] Richards, S., Aziz, N., Bale, S. et al. Standards and guidelines for the interpretation of sequence variants: a joint consensus recommendation of the American College of Medical Genetics and Genomics and the Association for Molecular Pathology. Genet Med 17, 405–423 (2015). https://doi.org/10.1038/gim.2015.30
    [9] 左伋. 医学遗传学 第7版[M].北京:人民卫生出版社, 2018.p97、104-115
    [10] 王卫平. 儿科学.第8版[M]. 人民卫生出版社, 2018.p431-435
    [11] 黄辉,沈亦平,顾卫红,黄颐,王小冬,高勇,熊慧,周在威,吴静,马端,安冬艳,张巍,傅琴梅,熊茜,彭智宇,汪亮,黄尚志,祁鸣.遗传病二代测序临床检测全流程规范化共识探讨(4)——检测报告解读和遗传咨询[J].中华医学遗传学杂志,2020(03):352-353-354-355-356-357.