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宝宝2岁半，昨天上午偶有咳嗽，中午突然开始高烧，最高39.9。
针对上述情况分析和建议：
1. 关于甲流阴性结果是否排除甲流感染？检测显示甲流阴性不能完全排除甲流感染的可能性。流感病毒检测的敏感性和特异性受采样时间、标本质量以及检测方法的影响。尤其是发热超过48小时后，病毒载量可能减少，增加假阴性风险。
孩子目前的症状（高热不退、退热后短时间内再次升高）以及流感高发季节，都要高度怀疑流感感染。奥司他韦仍建议继续服用，按疗程服满（通常为5天），以减少病程和并发症风险。
2.孩子发烧高达40°C，退热药作用时间不足怎么办？退热药交替使用：美林（布洛芬）和泰诺（对乙酰氨基酚）可以交替使用，每种药物间隔至少4-6小时，两者交替间隔可3-4小时。具体方案如下：比如早上8点服用泰诺，12点可以改用美林，16点再用泰诺。但如果能够单一就尽量单一。保持用药剂量准确，避免过量。
3.可用30-35°C的温水擦拭孩子的额头、腋下、颈部和大腿根部，帮助降温。保持室内通风和适宜的温度，避免过度包裹。
高热会引起脱水，需鼓励孩子少量多次饮水，可给予口服补液盐或淡盐水。
4.是否需要复诊或其他处理？若孩子持续高热超过48小时，伴随精神萎靡、严重咳嗽、呼吸急促、面色苍白或明显不适，建议尽快复诊。医生可能需要进一步检查（如胸片）以排除细菌性肺炎或其他合并症。如果体温无法通过退热药控制，且频繁高达39.5°C以上，建议复诊评估是否需要静脉补液或更强效的药物干预。
5.继续观察病情变化：关注精神状态、呼吸情况和进食情况。奥司他韦需按照医嘱完成疗程。尽管检测结果是阴性，临床表现仍可能支持流感的诊断，特别是持续高热的孩子流感概率较大，治疗不宜中断。阿奇霉素可以先挺停用，如果没有支气管炎或肺炎依据。
希望一切顺利。

血常规只能大致的分辨，可能是病毒可能是细菌，还是要结合孩子的临床症状体征综合分析的，那最为准确的还是要做病原学检查。从你们孩子问题的血常规来说，还是倾向病毒感染可能性大。

继续奥司他韦，观察。皮疹可能病毒疹，问题不大，先观察。

多补充液体。