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好的收到您的相关资料和描述的情况。
1.对于您目前的穿刺病理+基因检测，我们也是建议及时进行手术切除的，切除范围至少为一半的甲状腺，是否要全切，主要看看您对半切和全切的优缺点倾向进行选择。
2.因为虽然我们穿刺细胞看到是II类也就是二类的结果，肉眼观看下都是良性的甲状腺细胞，但是甲癌基因BRAF突变阳性一般就考虑99%以上都是甲状腺癌的情况了，所以是推荐您进行手术。
穿刺细胞出现良性改变的情况，有可能是因为这个粗大钙化， 因为这就像我们在石头上挂细胞出来化验，可能刮不到大的石块。但是目前刮下来的粉末检测出来异常，所以还是能够说明问题的。

3.我们做手术的话，一般不只切除结节，而至少要把带有病灶的右边一半的甲状腺全部切完才能够达到治疗的效果。因为第1个有可能切不到这个结节，第2个有可能切不干净这个结节，第3个切完后剩余甲状腺容易出血，所以我们都不建议做结节切除的。

4.我们甲状腺切除手术一般是把有风险这个右边切下来送去做化验，30分钟会出来这个冰冻病理的结果，来进一步明确结节的良性恶性情况的。如果它仍然考虑是恶性的情况下，您可以考虑只切除右边甲状腺（因为目前的超声描述左侧的囊性结节2类和混合性结节3类都是偏向良性的多），也可以考虑甲状腺全部切除。
具体切除一边切除两边都各有优缺点，看您更在意哪一方面的优缺点进行决定。

单侧腺叶切除
当结节只存在一侧甲状腺，另外一侧在超声下没有提示有结节时，或者结节考虑良性或者恶性程度不是很高时，没有合并严重的甲状腺炎症等时，可以考虑只切除一侧的甲状腺，保留另外正常的甲状腺。
优点，保留另外一侧甲状腺可以降低手术喉返神经，甲状旁腺损伤的风险。当结节为恶性时，保留一侧甲状腺能够提供一定的甲状腺功能，在服用优甲乐治疗5-10年后如果病情稳定，可以考虑停用优甲乐（但是确实有少部分病人有一半功能也不够，需要长期吃药），跟正常人一样定期复查即可。
缺点，当结节为恶性，而且恶性程度较高(复发危险度为中度危险及高度危险)时，可能存在二次手术切除另外一侧甲状腺风险(因为恶性程度较高的甲状腺肿瘤，我们推荐需要去做碘131治疗，但是前提需要甲状腺完全或绝大部分切除，所以建议还需要把另外一边正常的甲状腺切除)，具体的病理判断需要术后三个工作日才能出来。术后需要定期复查抽血及超声(比全切复查的次数多一些)。

双侧甲状腺全切
当双侧都有结节考虑恶性，合并严重的甲状腺炎症，患者本人担心另外一边正常的甲状腺恶变，或者单侧结节病理检查恶性程度比较高需要二次手术很抗拒时，建议将两侧甲状腺都完全切除。
优点，手术后不必担心剩下的一侧甲状腺恶变风险，术后可以根据抽血指标(促甲状腺激素，甲状腺球蛋白，甲状腺球蛋白抗体等)，评估目前癌症是否控制稳定等。
缺点:手术副损伤风险较单侧甲状腺切除高一些，而且可能会出现双侧神经麻痹，术后呼吸困难等表现（不过相对比较低），术后需要终生吃药。

所以两个方法都有优缺点，没有最好的方法，只有最适合自己的方法，到时候，您可以跟家里人共同商量之后具体决定哈。