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您好，概括下我的分析意见和建议。
1、主要是你家12岁女孩儿，近半月有多次发生上腹痛，胃镜提示胆汁反流性胃炎，生化提示肝功能异常，转氨酶很高，胆红素升高，梗阻酶学指标升高。B超显示胆囊有结石。输液以治疗胃炎和降转氨酶为主，住院五天后出院。6月6号再发腹痛、进食后为著，行ct和磁共振显示胆囊结石，胆总管末端结石。

2、目前诊断考虑梗阻性黄疸可能 胆总管末端结石 胆囊结石胆囊炎 肝功能异常。目前情况有明确手术指征，需要手术治疗处理，可以选择一步法外科手术切除胆囊+胆道探查取石，或者二步法先ERCP处理胆总管结石+后腹腔镜胆囊切除术。保守治疗能够暂且缓解症状，但胆囊炎还会容易再发，再次引起黄疸、甚至胆管炎、急性胰腺炎，就非常麻烦了。目前肝功能有问题，主要是通过药物保守治疗和手术治疗解决问题。日常注意低脂饮食，控制体重症状，避免超重，观察病毒变化必要时开启抗病毒药物药物控制乙肝病毒复制。胆囊结石与乙肝肝炎有关，胆囊结石掉入胆总管中引起黄疸和肝损伤。胆汁反流性胃炎是另外的消化内科问题。