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你好，谢谢你的信任。
你看看有没有最近的胸部CT电子图像？可以把网络链接或者二维码连同访问密码发给我，方便我直接观察图像。
目前肺穿刺病理检查结果提示隐球菌感染，证实肺隐球菌病。隐球菌是真菌的一种，正常人群很少发生隐球菌感染。如果有免疫力低下，长期服用激素，长时间抗菌药物使用，高龄营养状况差，或者肺部有基础疾病的，长时间潮湿密闭环境的，容易发生隐球菌感染，累及肺部，引起肺部炎症。治疗上，如果症状比较轻，一般氟康唑治疗，但疗程需要比较长，临床上一般之前半年。
服用氟康唑，或者其他抗真菌药物，可能会有肝肾损害，需要定期复查，跟踪肝肾功能变化，出现严重损害时需要调整剂量或者更换药物。
目前的咳嗽，如果仅仅是近期出现，尤其是肺穿刺后出现的，最好先复查一下胸部CT，排除气胸，或者炎症进展。一般肺穿刺后会马上复查胸部CT，排除严重气胸。临床上有些会有迟发的气胸，或者轻度气胸后期加重。如果有气胸，需要进行穿刺引流，排出气体。（从目前的肺功能检查结果来看，不是特别支持这种情况，但仍建议做一下胸部CT排除）
如果没有气胸，需要对比老片，是否有炎症进展，或者新发炎症，同时复查血常规，炎症指标，看看是否有合并感染，需要合并使用抗生素。
如果上述情况都有排除，一般对症治疗。目前已经在使用双氢可待因和惠菲宁，相对来说止咳强度还是很强的。可以尝试复方甲氧那明胶囊，这是一种复合制剂，含有抗过敏，镇咳，支气管扩张成分，一般用于慢性气道疾病，慢性咳嗽治疗。每日3次，每次两粒。也可以尝试雾化吸入，用一些吸入激素，比如布地奈德混悬液，或者联合支气管扩张药物吸入，比如特布他林雾化液。
上述处理后，仍有咳嗽反复，就要按慢性咳嗽进行排查，主要排除五官科疾病，比如慢性鼻炎鼻窦炎，咽喉炎，以及咳嗽变异性哮喘（可以做激发试验，就是吸入“诱发药物”后，对比吸入前后肺功能检查结果），过敏性咳嗽等慢性气道疾病。

复查胸部CT的主要目的是排除穿刺后造成的气胸，从当时穿刺后马上复查胸部CT图像上没有明显的气胸，但目前咳嗽剧烈，咳嗽本身也会加剧气胸的发生。
我截了张肺穿刺针进入肺部病灶的图像，帮助你理解肺穿刺操作。（穿刺本身会“刺破”肺部）
肺隐球菌病造成咳嗽加剧的可能性的确不大。但需要排除诊断隐球菌病做的肺穿刺的副作用。（咳嗽也是发生在穿刺后）
如果以前也发生过反复咳嗽，如果排除上述肺部新发问题，就需要按上述建议，按慢性咳嗽进行排查。（本次的肺部感染可能是一个诱发加重的诱因）。
简单总结一下我的个人意见，复查胸部CT排除包括气胸在内的肺部新发病变后，可以先经验性治疗，加用复方甲氧那明胶囊，雾化吸入。如果仍无改善，按慢性咳嗽进行排查。

肝功能检查目前在正常范围内。也和目前症状没有关系。
胃食管反流会引起咳嗽，胃部酸性液体气体向上反流，刺激咽喉部，造成咳嗽。典型症状，时有反酸嗳气。典型的通过胃镜就可以确认（食管黏膜可以看到炎症）。胃食管反流所致的咳嗽，很少有突然发作，加重的。从目前胃镜检查结果，也没有典型反流所致的食管炎表现。
我的建议，之前已经给出，不再重复。

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